糞便顯微鏡檢查還有一個重要的內容就是發現寄生蟲卵或蟲體，除了常規檢查發現寄生蟲外，還可通過集卵法提高檢出蟲卵的陽性率，還可通過染色法對寄生蟲進行細致觀察和鑒別。在臨床檢驗工作中最具有重要意義的診斷性報告，就是寄生蟲檢驗報告。可以在糞便中檢查到的寄生蟲有：蛔蟲，阿米巴原蟲，鞭蟲，鉤蟲，血吸蟲，蟯蟲，肺吸蟲，藍氏賈第鞭毛蟲，布氏姜片吸蟲，中華支睪吸蟲，絳蟲，隱孢子蟲，衛氏并殖吸蟲，纖毛蟲，短膜殼絳蟲，糞類圓線蟲，毛圓線. 糞便化學檢查